La Croix-Rouge Togolaise se compose aux niveaux national, régional, préfectoral et local, des organes suivants :des organes de décision (Assemblée Générale, Comité Central, Assemblée Régionale, Assemblée Préfectorale et Assemblée Locale); 

• des organes de direction (Comité de Direction, Comité Régional, Comité Préfectoral, Comité Local);
• des organes d’orientation (Commissions Techniques Nationales, Commissions Techniques Régionales,  Commission Nationale des Finances)

L’Assemblée Générale est l’instance suprême de décision de la Croix-Rouge Togolaise. Elle se compose de membres votants du Comité Central, des Délégués Régionaux, des délégués de la Jeunesse et des délégués Genre et Développement et des membres non votants (observateurs et représentants du personnel). Elle a le pouvoir entre autre:

• d'examiner, amender et adopter les politiques et orientations de la CRT, les rapports d’activités et de finances, le plan quadriennal, et le plan de financement;
• d'examiner et confirmer toute décision prise par le Comité Central concernant l’admission ou la suspension des Sections Locales et des membres de la CRT;
• d'élir les onze (11) membres du Comité de Direction (1 Président, 2 Vice-présidents ; 1 trésorier, 1 Conseiller Juridique, 6 Conseillers Techniques) et confirmer les 10 Délégués Régionaux élus par les Assemblées Régionales pour être membres du Comité Centra;
• etc.

L’Assemblée Générale se réunit au mois de décembre tous les cinq (05) ans en session ordinaire statutaire à la date et lieu prévus par la précédente Assemblée Générale ou par le Comité Central, en vertu des pouvoirs délégués à ce dernier par l’Assemblée Générale. Elle se réunit en session extraordinaire sur l’initiative du Comité Central ou à la demande d’un cinquième des membres votants de  l’Assemblée Générale.

Le Comité Central est l’instance de décision entre deux (02) Assemblées Générales. Il se compose de trente et un (31) membres votants, de six (06) membres non votants et des observateurs. Ce mimité a le pouvoir entre autre de:

• prendre des décisions et les mesures appropriées pour traiter les situations d’urgence affectant le fonctionnement de la CRT et l’exécution des activités adoptées par l’AG;
• superviser les politiques et orientations de la CRT;
• examiner et adopter les rapports d’activités et de finances présentés par le Comité de Direction;
• examiner et accepter les propositions du Comité de Direction  concernant les amendements des textes juridiques;
• etc.

Le mandat des membres votants du Comité Central est de cinq (05) ans renouvelable une seule fois.
il se réunit tous les cinq (05) ans en session ordinaire, à la date et lieu prévus par le précédent Comité Central ou par le Comité de Direction, en vertu des pouvoirs délégués à ce dernier par l’Assemblée Générale. Il se réunit en session extraordinaire sur proposition du Comité de Direction ou du 1/3 de ses membres votants.

Le Comité de Direction est l’organe de supervision de l’exécution des décisions prises par l’Assemblée Générale et le Comité Central. Il se compose de onze (11) membres votants élus par l’AG (Président National, Premier Vice-Président,Deuxième Vice-Président, Trésorier Général,Conseiller Juridique, et six (06) Conseillers Techniques Nationaux) et un membre non votant (Secrétaire Général). Le Comité de Direction a pour entre autres mandats de:

• établir les organes d’orientation et d’exécution (notamment le recrutement du Secrétaire Général et le reste du personnel de la CRT, le choix d’un cabinet d’audit pour le contrôle des comptes et les bilans de la Société Nationale);
• donner au Secrétaire Général des orientations sur l’exécution des décisions prises par l’Assemblée Générale et le Comité Central; 
• veiller à la promotion des opérations stratégiques de la CRT, notamment le développement institutionnel et les services d’assistance à tous les niveaux de la Société Nationale;
• entretenir des relations avec l’extérieur et les autres organes de la CRT;
• etc.

Le mandat des membres votants du Comité de Direction  est de cinq (05) ans renouvelable une  fois. Ils ne  peuvent assurer  plus de deux mandats consécutifs au même poste. Il se réunit une fois par mois en session ordinaire au siège de la Société Nationale.
Il peut se réunir en session extraordinaire sur convocation du Président ou à la demande de quatre (04) membres du Comité de Direction.

Les Commissions Techniques Nationales sont des organes d’orientation chargés de faciliter l’action du Secrétariat Général et ses départements techniques. Ce sont : les commissions nationales de santé, du genre et développement, de secours, de l’information et diffusion, de la jeunesse et de la gestion des volontaires, et du développement des ressources.
Elles collaborent avec le Secrétariat Général pour la planification et la revue du programme.

Les  Commissions se composent des membres d’office, notamment le Conseiller Technique National, les cinq Conseillers Techniques Régionaux, le Chargé de programme et les cinq Coordinateurs Régionaux.Chaque Commission se réunit annuellement.

Le Secrétariat Général est l’organe d’exécution des activités de la CRT. il a pour compétences,

• l'exécution des décisions prises par l’AG, le CC et le CD concernant : l’opération stratégique « Développement Institutionnel », « services d’assistance » et autres programmes complémentaires (par exemple  « Femme » et « developpement »);
• l'exécution de toutes les autres décisions prises par l’AG, le CC, le CD concernant le fonctionnement de la CRT;
• la supervision de l’implantation du programme Développement Institutionnel à tous les niveaux de la Société Nationale;
• le soutien des organes régionaux, préfectoraux et locaux concernant la formation et le suivi en matière d’administration.
• la gestion des Membres et des Volontaires de la CRT;
• la coordination du fonctionnement de la Société Nationale;
• l'élaboration des plans de travail annuels et quadriennaux basés sur les propositions des Départements Techniques au Comité de Direction;
• l'élaboration et Exécution des budgets annuels et budgets de fonctionnement trimestriels, en consultation avec le Trésorier Général , à l’attention du Comité de Direction;
• etc.

Dans le cadre de son « Programme institutionnel » la CRT se propose de régionaliser les structures statutaires du volontariat et son opération stratégique « services d’assistance ». Cette restructuration vise à l’établissement d’un cadre statutaire de la structure régionalisée de la CRT et à l’établissement d’un cadre de travail professionnel des activités.

Les structures régionales comprennent les organes régionaux et les services techniques qui animent les activités de la Société Nationale au niveau régional. Elle comprennent  les organes régionaux(l’Assemblée Régionale et le Comité Régional) et les services techniques (les Coordinations Régionales).

Le comité Préfectoral:
Au niveau préfectoral, Le Comité Préfectoral est l’organe de direction et de supervision des activités de la CRT.

Le Comité Préfectoral est composé comme suit (01 Président, 01 Secrétaire, 01 Trésorier, 06 Conseillers)

Le Comité local :
C’est l’organe de la gouvernance au niveau local, une émanation de l’assemblée générale à l’issue de laquelle un bureau de douze membres est élu pour un mandant de quatre ans. Ce bureau exécutif se compose comme suit :un président(e), un(e) vice président(e), un(e) secrétaire, un(e) secrétaire adjoint(e), un(e) trésorier(e), un(e) trésorier(e) adjoint(e) et de six conseillers (conseiller technique santé, conseiller technique secours, conseiller technique information diffusion, conseiller technique femmes, conseiller technique développement des ressources, conseiller technique, jeunesse).
Rappelons que seule les membres qui paient leur cotisation ont droit de vote et sont éligibles